甜瓜雖然是很受歡迎的蔬果，但是在很多方面上，食用甜瓜時還是要注意不少問題的，像是在適宜食用甜瓜的人群分類上，腎病患者宜食用；也適宜夏季煩熱口渴、口鼻生瘡或中暑的時候食用。每次半個。兒童飲用甜瓜汁，對于防治軟骨病有一定作用，而另一方面，出血及體虛者，脾胃虛寒、腹脹便溏者則是需要忌食，因為甜瓜性甘寒，凡脾胃虛寒、腹脹、腹瀉便溏者食用之后身體很有可能會出現不良反應。

而在從食物相克方面出發，在食用甜瓜時也是需要注意不少問題的，像是甜瓜不宜與田螺、螃蟹、油餅等同食，因為甜瓜會與這些食物的一些營養元素中和產生不良反應。還有就是由于甜瓜的助瀉利便作用顯著，所以一般人吃多了甜瓜，就會出現腹瀉腹痛癥狀。患有腳氣病、黃疸癥、腹脹、便滑的人及產后的女性、大病初愈的患者尤其不宜食用甜瓜。