除了食用價值外，馬齒莧的藥用價值也十分豐富。

馬齒莧的首要功效就是治療皮膚病，如痤瘡、毒瘡等，它有很好的清熱祛濕、消炎和抑菌的效果，所以對于由熱度引起的皮膚病療效顯著。其次，馬齒莧含有獨特的抗菌消炎成分，可殺滅腸道細菌，因此對治療痢疾、傷寒、瘧疾等也有很好的治療效果。目前，馬齒莧已被制作成各種片劑、注射液來使用。

馬齒莧含有豐富的蛋白質、維生素，另外還含有獨特的生物活性成分，曾強人體上皮細胞的活性，因此對各種出血和潰瘍都有治療作用。另外，馬齒莧還能降低血液中的膽固醇含量，因此有預防和治療心腦血管疾病的作用。